Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms