Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms