Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms