Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Med17Q8VCD5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms