Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmpQ8R373 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmpQ8R373 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms