Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf183Q8QZS5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms