Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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