Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vrk3Q8K3G5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vrk3Q8K3G5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vrk3Q8K3G5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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