Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms