Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms