Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc12Q8K2L8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms