Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms