Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms