Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms