Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc4a8Q8JZR6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc4a8Q8JZR6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms