Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms