Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwnkQ8CIW5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms