Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpm6Q8CIR4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trpm6Q8CIR4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpm6Q8CIR4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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