Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx8Q8CFD4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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