Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms