Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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