Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Strip2Q8C9H6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strip2Q8C9H6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms