Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ska3Q8C263 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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