Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim35Q8C006 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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