Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Ctdsp2Q8BX07 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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