Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms