Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms