Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Suds3Q8BR65 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Suds3Q8BR65 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Suds3Q8BR65 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms