Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Prpf18Q8BM39 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Prpf18Q8BM39 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prpf18Q8BM39 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prpf18Q8BM39 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prpf18Q8BM39 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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