Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc17a6Q8BLE7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc17a6Q8BLE7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms