Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms