Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nop53Q8BK35 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms