Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms