Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms