Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms