Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc38a9Q8BGD6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms