Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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