Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms