Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfascQ810U3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfascQ810U3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms