Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms