Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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