Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc27Q80YS5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms