Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms