Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sestd1Q80UK0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sestd1Q80UK0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms