Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms