Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms