Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Letm2Q7TNU7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms