Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmed3Q78IS1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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