Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms