Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm3bQ6ZPY7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm3bQ6ZPY7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms